Con información de la Embajada de Francia en México.
Lanzamiento del E- Biothon, una plataforma de red para
acelerar y avanzar la investigación en bioinformática
Fuente : © T. Goldmann IDRIS-CNRS
(cabinets du Blue Gene/P affectés au projet E-Biothon)
CNRS , IBM, INRIA , el Instituto Francés de la
Bioinformática y la innovadora puesta en marcha e- Biothon SysFera desplegará una plataforma experimental Cloud ( 1 ) para acelerar y avanzar la
investigación en biología, salud y medio ambiente. Con 200 terabytes ( 1.012
bytes) de almacenamiento y potencia de cálculo de 28 teraflops ( 1012 fracasos
), se proporcionará a los investigadores y la comunidad científica en general
una aplicación de portal y potencia de cálculo considerable.
Con E-Biothon se abordará
el tratamiento de los datos complejos en biología de hoy para desarrollar
software de aplicación del mañana. La plataforma se presenta desde 18 hasta 21
nov 2013 durante el gran evento de la informática de alto rendimiento: el salón
de Supercomputación (SC 13 ), en Denver.
Francia siempre ha estado a la vanguardia de la
investigación médica , especialmente en relación con los principales
"epidemias" de nuestro tiempo y patologías ( SIDA , cáncer o diabetes
). Análisis genético y proteómico de virus o de los pacientes es cada vez más
importante para ayudar a descubrir nuevos tratamientos. Los recientes avances
tecnológicos, tales como secuenciadores de alta velocidad permitirá a los
investigadores en la biología tienen acceso a grandes cantidades de datos en
bruto ( petabytes de datos se generan al año) sobre la composición de los
virus, las bacterias así como los seres humanos. Analizar estos datos para
extraer el significado, es una tarea de enormes proporciones que requiere
enormes cantidades de procesamiento de datos.
Es por estos tratamientos aceleran el CNRS , IBM, lnria , el
Instituto Francés de Bioinformática y SysFera unió ( 2 ) proporcionar a los
investigadores de la plataforma en la nube , hospedado en Idris ( 3 ) el centro
del CNRS para cálculo numérico intensivo , de alto rendimiento , que se
encuentra en Orsay . Combinando portal de aplicaciones y potencia de cálculo
considerable , desarrollará los programas y aplicaciones que acelerarán la
investigación en la biología y la salud , sobre todo en la genómica y la
proteómica. El objetivo es avanzar en la comprensión más rápida de las
enfermedades genéticas , incluyendo las enfermedades neuromusculares y acelerar
drásticamente el descubrimiento de nuevos tratamientos hacia fuera . También
tiene como objetivo acelerar la investigación en ecología , biodiversidad para
comprender mejor nuestro entorno .
La plataforma consiste en sistemas de alto rendimiento / P
de IBM BlueGene con una capacidad total de 28 teraflops asociados con 200
terabytes de almacenamiento , y la solución SysFera -DS que proporciona a los
usuarios un portal web para el acceso a los recursos informáticos . A través de
este portal, los investigadores tienen acceso a cualquier entorno de trabajo
que les permite simplemente realizan el procesamiento de datos en relación con
los análisis en las áreas de la genómica, la proteómica y la metabolómica y
luego administrar los datos generados , todo ello a desde un simple navegador
web .
En un primer momento, tres aplicaciones piloto fueron
desplegados , en particular en los campos de la epidemiología y la
biodiversidad. Después de esta fase de despliegue inicial, el objetivo ahora es
abrir esta apoyado por Francia y Rejillas Instituto Francés de la plataforma
bioinformática , toda la comunidad científica .
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